Navazující magisterské studium
Délka studia jsou 2 roky a má formu pouze prezenčního studia, tzn. student navštěvuje přednášky, cvičení a semináře v průběhu celého týdne.
Uchazeč si po úspěšném splnění přijímacích zkoušek může vybrat z programů a jejich specializací, přičemž řada z nich má již přímou návaznost z bakalářského studia (viz Bakalářské studium).
Co musí uchazeč o studium splnit:
- Absolvovat bakalářské studium na technické univerzitě v ČR nebo v zahraničí
- Úspěšně absolvovat přijímací zkoušky do magisterského studia (u studentů FJFI ČVUT v Praze, kteří pokračují v navazujícím oboru, může být zkouška prominuta na základě výsledku státní závěrečné zkoušky Bc. studia).
Absolventovi je po získání předepsaného počtu kreditů (120), splnění všech předepsaných předmětů, odevzdání a obhájení diplomové práce a úspěšném zvládnutí státní závěrečné zkoušky udělen titul Inženýr (Ing.) a je slavnostně promován v Betlémské kapli. Následně má absolvent možnost pokračovat v doktorském studiu (viz Doktorské studium) nebo odejít do praxe (viz Absolventi).
Navazující magisterské studium je aktuálně členěno do studijních směrů dle níže uvedeného přehledu v tabulce. Tento přehled zohledňuje akreditační proces.
Nově akreditované studijní programy mají v tabulce značku (p). Studijní směry původní, stále platné akreditace - obory studijního programu Aplikace přírodních věd - mají značku (o). V případě schválení nové akreditace studijního směru označeného (o) v průběhu vyhlášeného přijímacího řízení se uchazeči budou moci zapsat do nově akreditované podoby tohoto studijního směru. V případě, že akreditační řízení studijního směru označeného (o) nebude dokončeno do 25. 8. 2020, uchazeči se budou zapisovat do takového studijního směru (o) jako do oboru studijního programu Aplikace přírodních věd.
Uchazeč si vybírá při podání přihlášky právě jeden studijní směr z níže uvedených.
| studijní směr | zkratka | akreditace |
| Matematické inženýrství | P_MIN | (p) |
| Matematická fyzika | P_MFN | (p) |
| Aplikované matematicko-stochastické metody | P_AMSM_N | (p) |
| Matematická informatika | P_MINFN | (p) |
| Fyzikální elektronika | P_FEN | (p) |
| - specializace Laserová fyzika a technika | LFT | (p) |
| - specializace Fotonika | FOT | (p) |
| - specializace Počítačová fyzika | PF | (p) |
| Jaderné inženýrství | P_JIN | (p) |
| - specializace Aplikovaná fyzika ionizujícího záření | AFIZ | (p) |
| - specializace Jaderné reaktory | JR | (p) |
| Jaderná a částicová fyzika | P_JČFN | (p) |
| Radiologická fyzika | P_RF | (p) |
| Inženýrství pevných látek | P_IPLN | (p) |
| Fyzikální inženýrství materiálů | P_FIMN | (p) |
| Fyzika plazmatu a termojaderné fúze | P_FPTFN | (p) |
| Vyřazování jaderných zařízení z provozu | P_VJZPN | (p) |
| Aplikace softwarového inženýrství | ASI | (o) |
| Jaderná chemie | P_JCHN | (o) |
Pozn. Ve srovnání s bodem I. směrnice č. 5-2019 program P_AMSM_N odpovídá oboru AMSM, specializace P_MINFN odpovídá oboru MINF, specializace LFT odpovídá oboru LTE a ON, specializace PF odpovídá oboru IF, specializace AFIZ odpovídá oboru DAIZ, specializace JR odpovídá oboru JI, specializace P_IPLN odpovídá oboru IPL, specializace P_FIMN odpovídá oboru DM, specializace P_FPTFN odpovídá oboru FTTF.